Biomarcadores epigenéticos en
cáncer: un pilar de la oncología de precisión
Los últimos avances
en oncología están enfocados en la búsqueda y detección de biomarcadores que determinan el perfil
clínico-patológico y definen el perfil molecular del tumor, entre los que
destacan los biomarcadores epigenéticos. Estos son moléculas biológicas que se
encuentran en la sangre, otros fluidos corporales o tejidos, resultado de un
proceso normal o anormal, o de una afección o enfermedad. Los biomarcadores se
basan en el uso de sistemas de microarrays y secuenciación masiva que permiten
el análisis del epigenoma, esto supone un avance frente a los análisis
realizados tradicionalmente sobre un gen concreto. A nivel clínico tiene gran
relevancia el estudio de los biomarcadores epigenéticos en biopsia líquida que
posibilitara la detección del tumor y seguimiento de la enfermedad mediante
análisis no invasivos, lo que supondrá un aumento del bienestar del paciente y
un tratamiento personalizado.
Se han descrito en
diferentes enfermedades como el cáncer, en la que destaca la importancia de las modificaciones epigenéticas, entre ellas la metilación del
ADN y los ARNs no codificantes (ncRNAs) especialmente los microARNs (miRNas)
y los ARN largos no codificantes (IncRNAs).
Se ha desarrollado una prueba epigenética llamada EPICUP que se basa en la
detección de metilación de ADN en muestras de tejidos tumoral con utilidad para
identificar los tumores de origen desconocido o “cancer of unknown primary”
(CUP). Asimismo, nuevos estudios han afirmado la importancia del los ncRNAs en
el estudio del cáncer, han descubierto una asociación entre el silenciamiento
de la expresión de los ncRNAs y la metilación del ADN. Un claro ejemplo es la
inactivación epigenética por hipermetilación en cáncer de un lncRNA inducido
por p53 denominado TP53TG1. El silenciamiento de este gen se ha relacionado con
la resistencia a diferentes fármacos en tumores gastrointestinales.
Además, la biopsia
líquida es otra de las nuevas herramientas clínicas que ha cobrado gran
importancia, esta técnica está basada en el análisis del material circulante
presente en los fluidos biológicos que provienen de tumores, siendo una técnica
no invasiva, más segura que otras alternativas y que permite un seguimiento del desarrollo del
tumor. En el material circulante pueden detectarse componentes de la maquinaria
epigenética como DNA y ncRNAs metilados.
Recientemente se ha
validado un firma epigénetica para el diagnóstico precoz de cáncer de pulmón
basada en la metilación de 4 genes (BCAT1, CDO1, TRIM58,
y ZNF177), esto ha sido posible mediante la toma de muestras de
biopsia líquida y su posterior análisis de expresión con los sistemas de
microarrays. Todas estas nuevas herramientas clínicas se orientan a la mejora
del diagnóstico, pronóstico y tratamiento de los pacientes que padecen cáncer.
Revista
Referencias
Berdasco M,
Esteller M. Aberrant epigenetic landscape in cancer: how cellular identity goes
awry. Dev Cell. 2010; 19: 698-711. doi: 10.1016/j.devcel.2010.10.005
Berger SL, et al.
An operational definition of epigenetics. Genes Dev. 2009; 23: 781-3. doi:
10.1101/gad.1787609
By Tamara Alonso (DGMol)
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